Si alza da solo ... mese dopo mese. Tienile lontane da scontri armati per 5-6 mesi e il morale tornerà al massimo.
Se non sbaglio scende anche quando abbassi il mantenimento mensile e (ma non ne sono sicuro) se superi il limite di soldati nella provincia (ma potrebbero semplicemente diminuire gli effettivi senza intaccare il morale, non ricordo bene)Scende anche quando durante l'assedio fai un assalto, quando il morale arriva a zero (o quando i fanti scendono a zero) l'assalto termina.
A voler essere completi scende anche quando passi ad un nuovo tipo di unità nazionale, ma solo per quanto riguarda la tipologia di truppa interessata. Ossia se passi da cavalleria feudale a caracollo il morale si abbassa solo ai reggimenti di cavalleria, per poi rialzarsi con il passare del tempo.